农田纠纷应该向 乡级人民政府或县级以上人民政府寻求解决。具体处理部门可能包括土地管理部门、乡镇人民政府、人民调解委员会等。在实际操作中,可以先通过村委会或镇政府进行调解,如果调解无效,再向土地管理部门申请确权,最后可以选择向法院提起诉讼。