非法营运的证据主要包括以下几类：

书证：

包括收据、发票等，这些文件能够证明非法营运行为的发生和交易金额。

物证：

例如营运的相片、录音录像等，这些视听资料能够直观地记录非法营运的过程和情况。

当事人陈述：

包括双方当事人的询问笔录，能够反映非法营运的具体细节和当事人的态度。

交警执法记录：

交警在执法过程中记录的相关证据，能够证明非法营运行为的存在。

证人证言：

如果有目击者或其他相关人员能够提供证言，也可以作为证据。

鉴定意见：

在某些情况下，可能需要专业的鉴定意见来确认某些证据的真实性或有效性。

其他相关证据：

如行为人没有合法营运权的证据、超越许可事项从事营运的证据等。

这些证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。在实际操作中，证据的收集和保存应遵循法律规定，确保证据的合法性和有效性。