企业纠纷的归属部门主要取决于纠纷的性质和类型：
劳动纠纷应首先向调解组织申请调解。如果不愿调解、调解不成或达成调解协议后不履行，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
企业之间的业务或合同纠纷，如果协商不能解决，可以通过法院起诉解决。
企业内部的纠纷，如管理纠纷、知识产权纠纷等，通常由企业的法务部门处理或委托律师事务所处理。
对于涉及行政机关的纠纷，可以向双方当事人的上级业务主管部门申请行政调解。
通过仲裁机构进行调解，调解部门为仲裁机构。
诉讼中的调解由法院负责。
建议
劳动纠纷：建议首先尝试调解，若调解无效则申请劳动仲裁，最后可提起诉讼。
合同纠纷：建议先尝试协商，若协商无果则通过法院起诉解决。
其他类型的企业纠纷：建议通过法务部门或聘请律师处理。
选择合适的解决方式有助于更高效和公正地解决企业纠纷。
