企业在发放工资时需要交纳的税种主要包括以下几种：

企业所得税：

这是针对企业盈利部分征收的税种。工资作为企业成本的一部分，可以在计算企业所得税时抵减应纳税所得额，但企业需要按照规定的税率缴纳相应的企业所得税。

增值税：

如果企业提供的工资服务属于应税服务，例如为其他公司提供人力资源服务并收取费用，那么需要缴纳增值税。但一般的工资发放并不属于应税服务，因此大部分企业不需要就工资缴纳增值税。

个人所得税：

这是针对员工个人所得征收的税种。员工的工资超过个人所得税的起征点（例如3500元）后，需要缴纳个人所得税。个人所得税采用超额累进税率，计算公式为：应纳税额 =（工资薪金所得 - 五险一金 - 扣除数）* 适用税率 - 速算扣除数。

印花税：

在某些情况下，与工资相关的合同或凭证可能需要缴纳印花税。例如，企业与员工签订的劳动合同或工资支付凭证被认定为应税凭证时，需要按照相关法规缴纳印花税。但这并非所有地方都有要求，具体规定因地区而异。

除了上述税种外，企业还需注意其他可能的税种，例如：

流转税：包括增值税、营业税、城市维护建设税、教育费附加等。

个人所得税：除了上述的个人所得税外，员工还需要缴纳个人所得税。

其他税种：包括消费税、资源税、房产税、城镇土地使用税、印花税、车船税、土地增值税、车辆购置税、契税和耕地占用税等。这些税种一般企业不涉及，即使涉及，其计征金额很小，对企业影响也很小。

综上所述，企业在发放工资时需要交纳的税种主要是企业所得税、增值税和个人所得税，具体情况可能因企业业务性质和地区规定而有所不同。建议企业咨询当地税务部门或专业税务顾问，以确保合规操作。