领导扣除员工奖金可能基于以下几个原因：

公司经营状况

当公司从稳定期向收缩期转变时，可能会采取扣钱的方式来留人。

绩效考核

奖金通常与员工的绩效考核挂钩，如果考核结果不理想，领导有权扣除奖金。

公司规定

公司可能设定了特定的规定，比如试用期员工可能无法获得奖金，或者离职员工不发放年终奖。

法律法规

扣除奖金的行为必须符合劳动法规定，否则可能构成违法行为。

领导决策

领导可能因为个人工作不到位，将责任推给员工，并以此作为扣奖金的理由。

员工表现

如果员工的行为或工作成果未达到公司的预期标准，领导可能会扣除其奖金。

在处理此类问题时，员工应当首先了解扣奖金的具体原因，并尝试与领导进行沟通。如果沟通无果，员工可以考虑收集证据，通过合法途径维护自己的权益。