水利建设基金的计算方法如下：
水利建设基金按照营业收入的千分之一缴纳。
对于小规模纳税人，水利建设基金通常按当月要缴纳的增值税金额的0.5%征收。
水利建设基金由中央水利建设基金和地方水利建设基金组成。
中央水利建设基金主要用于关系国民经济和社会发展全局的大江大河重点工程的维护和建设。
地方水利建设基金主要用于城市防洪及中小河流、湖泊的治理、维护和建设，跨流域、跨省（自治区、直辖市）的重大水利建设工程和跨国河流、国界河流我方重点防护工程的治理费用由中央和地方共同负担。
申报水利建设基金可以登录当地电子税务局网站，通过税号和密码登录，或者在电脑上插入金税盘以证书方式登录。
申报时，一般要先完成增值税申报，然后在增值税申报完成后申报城建税和教育附加费，地方水利基金包含在这个报表中。
水利建设基金收支纳入政府性基金预算管理，实行专款专用，年终结余结转下年度安排使用。
各级水行政主管部门根据水利建设规划，编制年度水利建设基金支出预算，经同级财政部门审核后，纳入政府性基金预算。财政部门根据批准的水利建设基金预算和基金实际征收入库情况拨付资金。
水利建设基金的税率是收入的千分之一。
提取水利建设基金时，借管理费用，贷其他应付款；上交时，借其他应付款，贷银行存款。
建议：
具体的征收比例和申报流程可能因地区而异，建议咨询当地税务部门以获取最准确的信息。
企业在申报水利建设基金时，应确保所有材料和手续的准确性和完整性，以便顺利通过审核。
